Le principe du traitement consiste à mettre en contact une biomasse composée de bactéries aérobies (c'est à dire se développant en présence d'oxygène), des substances nutritives (substances organiques présentes dans les eaux et constituant la pollution) et de l'air.
Les bactéries en présence d'air se nourrissent des substances organiques et se reproduisent par scissiparité (scission en deux parties égales de la bactérie).
Les bactéries s'agglomèrent en incorporant également une partie des matières en suspension. Les matières organiques solubles sont ainsi transformées en flocons, particules de grosse taille plus facilement décantables.
Les principaux types de traitement sont :
A la sortie de l'étage d'épuration biologique, l'eau épurée est mélangée à la biomasse formée.
La séparation de ces éléments se réalise dans un clarificateur où la biomasse, de densité supérieure à celle de l'eau, va se déposer dans le fond de l'ouvrage.
La biomasse est soit renvoyée en tête du traitement biologique, soit extraite vers le traitement des boues.
L'eau épurée est quant à elle envoyée vers le milieu naturel.
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